國家執業藥師資格考試科目分為：

藥學類：

藥事管理與法規（藥學類、中藥學類共考科目）

藥學專業知識（一）含藥劑學、藥物化學、藥效學、藥物分析

藥學專業知識（二）含臨床藥物治療學、臨床藥理學

藥學綜合知識與技能

中藥學類：

藥事管理與法規（藥學類、中藥學類共考科目）

中藥學專業知識（一）含中藥學、中藥化學、中藥炮制學、中藥藥劑學、中藥藥理學、中藥鑒定學

中藥學專業知識（二）含臨床中藥學、中成藥學和方劑學

中藥學綜合知識與技能

各科單獨考試，單獨計分，執業藥師每科試卷滿分為120分。